Rcpp和RcppArmadillo创建R语言包的实现方式

目录
  • 1. 预先准备
    • 源文件示例func.cpp
    • 头文件示例test_h.h
  • 2. 创建R包步骤
    • 新建R Package
    • R包的文件结构
    • 修改DESCRIPTION文件
  • 3. C++11标准问题

1. 预先准备

Windows下需要安装Rtools，R中装好Rcpp和RcppArmadillo。创建C++源文件func.cpp，自定义头文件test_h.h。

源文件示例func.cpp

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
#include <RcppArmadillo.h>
#include <vector>
#include "./test_h.h"

using namespace Rcpp;
using namespace std;
// using namespace arma;

// [[Rcpp::export]]
RObject func(){
  arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu);
  std::cout<<CONDIT<<std::endl;
  return wrap(A);
}

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]：用于指明需要使用RcppArmadillo。

// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]：指明需要使用C++11。

#include "./test_h.h"：表示使用第三方头文件。第三方头文件需要用双引号""包括起来，并加上.h。./表示在当下文件夹(src)下搜寻文件。

// using namespace arma;不一定有用。如果要用Armadillo的数据结构，在其之前需指明arma::。

func()函数将可以直接在R中调用。

头文件示例test_h.h

#include <iostream>
#define CONDIT 1000

2. 创建R包步骤

新建R Package

选择Package w/Rcpp, 并添加源文件。或者建立包以后，手动复制到src文件夹下。

R包的文件结构

修改DESCRIPTION文件

将RcppArmadillo添加进Imports和LinkingTo中。

Package: RcppPackTest
Type: Package
Title: What the Package Does (Title Case)
Version: 0.1.0
Author: Who wrote it
Maintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net>
Description: More about what it does (maybe more than one line)
    Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.
License: What license is it under?
Encoding: UTF-8
LazyData: true
Imports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadillo
LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo

Build & Reload 建立包

3. C++11标准问题

如果要使用C++11标准，第一种方法是在Makevars文件中添加如下代码：

CXX = g++-4.8.1
PKG_CXXFLAGS = -std=c++11

第二种方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

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