perl 指定长度并生成一个随机的DNA序列的脚本代码

代码如下:

#!/bin/perl

use strict; 
use warnings;

#进行定义 
my @dna; 
my $dna_length; 
my $newbase; 
my $i=0;

print "please input the DNA length\n"; 
chomp($dna_length=<>);

while($i<$dna_length) 
{ 
  #从四个碱基中随机选取一个 
  my(@nucleotides)=qw/A T G C/; 
  $newbase=$nucleotides[rand @nucleotides];

#将随机生成的序列添加到@dna的数组中 
  push(@dna,$newbase); 
  ++$i; 
} 
print "@dna";

赞 (0)

相关推荐

  • perl产生随机数实现代码

    Perl利用函数rand()和srand()为随机数(更确切的说是"伪随机数")字符串的生成提供了基本的工具.这些函数不是利用加密来提供安 全性的,所以不要利用它们为你金融信息的加密.但是,如果你需要为你的下一个游戏或者动态Web网站的新特性设计一个简单的随机数生成器,那么 rand()和srand()可能就是你所需要的. 函数rand()是真正的随机数生成器,而srand()会设置供rand()使用的随机数种子.函数rand()会返回一个处于0和你所指定的数 值(缺省为1)之间的分数

  • perl生成特定碱基比例的随机序列的代码

    方法一(不使用模块,by agonyr) 复制代码 代码如下: #!/usr/bin/perl -w use strict; my @seq = ( "A", "T", "C", "G" );my $length = 10000; undef my %hash;$hash{"A"} = int( $length * 0.3 );$hash{"C"} = int( $length * 0.

  • perl写的一个随机编故事的程序(rand随机函数)

    复制代码 代码如下: #!/bin/perluse strict;  use warnings; #定义变量  my $count;  my $input;  my $number;  my $sentence;  my $story; #定义四个数组  #定义了人物数组  my @nouns=  (     'Dad',     'TV',     'Mom',     'Groucho',     'Rebecca',     'Harpo',     'Robin Hood',     '

  • 使用Perl生成随机密码

    可以通过参数控制生成密码中包括的字符种类 #!/usr/bin/perl use strict; use warnings; use Getopt::Std; sub show_help { print "Useage:\n"; print "newp -aAnsl\n"; print "-a\t\t the password contains lower case letters(a-z)\n"; print "-A\t\t the

  • perl 指定长度并生成一个随机的DNA序列的脚本代码

    复制代码 代码如下: #!/bin/perl use strict;  use warnings; #进行定义  my @dna;  my $dna_length;  my $newbase;  my $i=0; print "please input the DNA length\n";  chomp($dna_length=<>); while($i<$dna_length)  {    #从四个碱基中随机选取一个    my(@nucleotides)=qw/A

  • Java打乱ArrayList生成一个随机序列列表

    前言 在做试卷的时候,需要将一个句子中的单词.一个单词中的字符.选择题中的答题项打乱生成一个随机的序列,下面我将其抽象成工具类,方便大家以后复用. 示例代码 public static <V> boolean isEmpty(ArrayList<V> sourceList) { return (sourceList == null || sourceList.size() == 0); } /** * 打乱ArrayList * * */ public static <V&g

  • Python一阶马尔科夫链生成随机DNA序列实现示例

    Python一阶马尔科夫链生成随机DNA序列实现示例

    目录 1. 原理 2. 代码实现 3. 运行结果 1. 原理 对于DNA序列,一阶马尔科夫链可以理解为当前碱基的类型仅取决于上一位碱基类型.如图1所示,一条序列的开端(由B开始)可能是A.T.G.C四种碱基(且可能性相同,均为0.25),若序列的某一位是A,则下一位碱基是A.T.G.C的概率分别为0.25.0.20.0.20.0.20,下一位无碱基(即序列结束,状态为E)的概率为0.15. 图1 DNA序列的一阶马尔科夫链 2. 代码实现 以下代码运行于Jupyter Notebook (Pyt

  • Python中生成一个指定长度的随机字符串实现示例

    方法一: 定义一个函数,参数为所要生成随机字符串的长度.通过random.randint(a, b)方法得到随机数字,具体函数如下: def generate_random_str(randomlength=16): """ 生成一个指定长度的随机字符串 """ random_str = '' base_str = 'ABCDEFGHIGKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefghigklmnopqrstuvwxyz0123456789' l

  • python随机生成指定长度密码的方法

    本文实例讲述了python随机生成指定长度密码的方法.分享给大家供大家参考.具体如下: 下面的python代码通过对各种字符进行随机组合生成一个指定长度的随机密码 python中的string对象有几个常用的方法用来输出各种不同的字符: string.ascii_letters 输出ascii码的所有字符 string.digits 输出 '0123456789'. string.punctuation ascii中的标点符号 print string.ascii_letters print s

  • JAVA编程实现随机生成指定长度的密码功能【大小写和数字组合】

    本文实例讲述了JAVA编程实现随机生成指定长度的密码功能.分享给大家供大家参考,具体如下: import java.util.Random; public class PassWordCreate { /** * 获得密码 * @param len 密码长度 * @return */ public String createPassWord(int len){ int random = this.createRandomInt(); return this.createPassWord(rand

  • js随机生成一个验证码

    js随机生成一个验证码

    之前接触过的验证码都是图片,今天碰到了一个用js生成随机验证码的demo,拿来敲一敲和大家分享. 效果: html代码: <p>验证码:</p> <div id="login" onclick="change()"> <a href="#" rel="external nofollow" ></a> </div> 给div设置了一个click点击事件,js

  • php使用指定字符列表生成随机字符串的方法

    本文实例讲述了php使用指定字符列表生成随机字符串的方法.分享给大家供大家参考.具体如下: <?php function randomString($len) { srand(date("s")); $possible="ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefghijklmnopqrstuvwxyz1234567890!@#$%^&*()"; $str=""; while(strlen($str)<$

  • Python随机生成一个6位的验证码代码分享

    1. 生成源码 复制代码 代码如下: # -*- coding: utf-8 -*- import random def generate_verification_code():     ''' 随机生成6位的验证码 '''     code_list = []     for i in range(10): # 0-9数字         code_list.append(str(i))     for i in range(65, 91): # A-Z         code_list.

  • java随机生成一个名字和对应拼音的方法

    本文实例讲述了java随机生成一个名字和对应拼音的方法.分享给大家供大家参考.具体如下: package com.cn.wangk.util.name; import java.util.Random; import com.cn.wangk.util.StrTools; public class ChineseName { String[] sName = new String[95]; String[] Name = new String[79]; private String Names;

随机推荐