基于python读取.mat文件并取出信息

这篇文章主要介绍了基于python读取.mat文件并取出信息,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友可以参考下

导入所需包

from scipy.io import loadmat

读取.mat文件

随便从下面文件里读取一个:

m = loadmat('H_BETA.mat') # 读出来的 m 是一个dict(字典)数据结构

读出来的m内容:

m:{'__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: GLNXA64, Created on: Mon Aug 5 17:14:09 2019',
 '__version__': '1.0',
 '__globals__': [],
 'H_BETA': array([[ 0.68508148, 0.36764355, 0.73505849, ..., 0.27600164,
     0.67968929, 0.70506438],
    [ 0.74920812, 1.10949748, 0.47506305, ..., 0.32871445,
     0.61247345, 1.06948844],
    [ 0.83311522, 1.06321302, 0.97364609, ..., 0.85837753,
     0.96296771, 1.46095171],
    ...,
    [    nan,     nan,     nan, ...,     nan,
         nan, -9.04648469],
    [    nan,     nan,     nan, ...,     nan,
         nan,     nan],
    [    nan,     nan,     nan, ...,     nan,
In [29]: m.keys()
Out[29]: dict_keys(['__header__', '__version__', '__globals__', 'H_BETA'])

取出.mat里所需信息

.mat 文件里的数据结构是 dict ,所以取值要按照 key:value 的形式:

In [30]: m['H_BETA']
Out[30]:
array([[ 0.68508148, 0.36764355, 0.73505849, ..., 0.27600164,
     0.67968929, 0.70506438],
    [ 0.74920812, 1.10949748, 0.47506305, ..., 0.32871445,
     0.61247345, 1.06948844],
    [ 0.83311522, 1.06321302, 0.97364609, ..., 0.85837753,
     0.96296771, 1.46095171],
    ...,
    [    nan,     nan,     nan, ...,     nan,
        nan, -9.04648469],
    [    nan,     nan,     nan, ...,     nan,
        nan,     nan],
    [    nan,     nan,     nan, ...,     nan,
        nan,     nan]])

In [31]: type(m['H_BETA'])
Out[31]: numpy.ndarray

预处理数据

上面读出来的数据是 ndarray 类型,为了方便数据的展示,我们可以将其转换为,pandas的DataFrame:

In [32]: import pandas as pd
In [33]: df = pd.DataFrame(m['H_BETA'])
In [34]: df.head()
Out[34]:
    1     2     3     4     5     6     7     8     9     10
 0.685081 0.367644 0.735058 0.085046 0.104332 0.560731 0.350219 0.758185 0.303823 0.114022 0.452877
 0.749208 1.109497 0.475063 0.896100 1.117772 0.611356 0.662669 0.603077 0.863930 0.756870 0.725808
 0.833115 1.063213 0.973646 0.935061 0.631670 0.916800 0.662993 0.543231 0.671558 1.027954 0.526402
 0.488906 0.932741 0.956622 0.573116 0.893764 0.987304 0.380807 1.211157 0.550213 0.898408 1.153289
 0.440694 0.503209 0.509693 0.477054 0.344717 -0.054662 1.124213 0.344906 0.612898 0.217625 -0.129715 

[5 rows x 2111 columns]

如此,数据就比较规整了,是保存成文件,还是做其他处理,就by yourself啦!

以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持我们。

(0)

相关推荐

  • 使用matlab或python将txt文件转为excel表格

    假设txt文件为: 一.matlab代码 data=importdata('data.txt'); xlswrite('data.xls',data); 二.python代码 利用pandas的DataFrame输出为Excel[但是输出会有索引] 结果为: import numpy as np import pandas as pd def getData(path): with open(path, 'r') as file: data = [] for line in file.readl

  • python matplotlib如何给图中的点加标签

    这篇文章主要介绍了python matplotlib给图中的点加标签,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友可以参考下 在写论文用到matplotlib画散点图,想着如果能把每个点对应的ID打在点的旁边就好了,经过一番搜索,最后找到了方法. 首先是打点,先把所有的点画好,举例如下: p1 = ax.scatter(X[:,0], X[:,1], marker = '*', color = 'r', label='1', s=10) 再依次给每个点打

  • python matplotlib饼状图参数及用法解析

    这篇文章主要介绍了python matplotlib饼状图参数及用法解析,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友可以参考下 在python的matplotlib画图函数中,饼状图的函数为pie pie函数参数解读 plt.pie(x, explode=None, labels=None, colors=None, autopct=None, pctdistance=0.6, shadow=False, labeldistance=1.1, star

  • python库matplotlib绘制坐标图

    很多时候我们数据处理的时候要画坐标图,下面我用第三方库matplotlib以及scipy绘制光滑的曲线图 需要安装的库有 matplotlib,scipy, numpy import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np from mpl_toolkits.axisartist.axislines import Subplot from scipy import interpolate def sommth_plot(x_arr, y_arr):

  • python、Matlab求定积分的实现

    python求定积分 计算 from sympy import * x = symbols('x') print(integrate(sin(2*x)/(1+x**2), (x, 0, 3))) sympy库中integrate函数 integrate(f, (x, lower_bound, upper_bound)) # f-函数,x-变量,lower_bound-下限,upper_bound-上限 但是发现求不出来,如果是sin(2*x)就可以,为什么? matlab求定积分 syms x

  • python matplotlib 画dataframe的时间序列图实例

    在python中经常会用到pandas来处理数据,最常用的数据类型是dataframe,但是有时候在dataframe有时间字段需要画时间序列图的时候会遇到一些问题,下面是我处理这个问题的一个小案例,希望可以帮到在坑里的小朋友哦,开个小玩笑. code as fallows: doc_list = [] doc_target = doc.iloc[:, 141:142] for i in doc.iloc[:, 3:4].values.tolist(): for j in i: doc_list

  • 详解Python中的format格式化函数的使用方法

    format函数实现字符串格式化的功能 基本语法为: 通过 : 和 {} 来控制字符串的操作 一.对字符串进行操作 1. 不设置指定位置,按默认顺序插入 ①当参数个数等于{}个数的时候 str_1 = "小明{}小美,可是小美{}小明".format("喜欢", "不喜欢") print(str_1) 运行结果: ②当参数个数大于{}个数的时候 str_1 = "小明{}小美,可是小美{}小明".format("喜欢

  • python使用pip安装SciPy、SymPy、matplotlib教程

    背景: 使用pip install SciPy的格式安装python函数库SciPy的时候,发现老是报错,从网上找信息也没找到合适的解决办法,最后使用whl格式文件安装成功. 过程: 本人事先电脑安装了python3.5.2,电脑是64位的. 下载函数库:从网址http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/下载对应函数库的whl文件.注意下载对应的python版本和windows版本的whl文件,这里讲一下文件的规则:scipy‑0.19.1‑cp35‑cp

  • 基于python读取.mat文件并取出信息

    这篇文章主要介绍了基于python读取.mat文件并取出信息,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友可以参考下 导入所需包 from scipy.io import loadmat 读取.mat文件 随便从下面文件里读取一个: m = loadmat('H_BETA.mat') # 读出来的 m 是一个dict(字典)数据结构 读出来的m内容: m:{'__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: GL

  • python读取.mat文件的数据及实例代码

    首先导入scipy的包 from scipy.io import loadmat 然后读取 m = loadmat("F:/__identity/activity/论文/data/D001.mat") 注意这里m是一个dict数据结构 >>> m {'__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: PCWIN, Created on: Mon Aug 15 22:16:43 2011', '__globals__': [],

  • Python读取mat文件,并转为csv文件的实例

    初学Python,遇到需要将mat文件转为csv文件,看了很多博客,最后找到了解决办法,代码如下: #方法1 from pandas import Series,DataFrame import pandas as pd import numpy as np import h5py datapath = 'E:/workspacelxr/contem/data.mat' file = h5py.File(datapath,'r') file.keys() def Print(name):prin

  • Python读取mat文件,并保存为pickle格式的方法

    这两天在搞Theano,要把mat文件转成pickle格式载入Python. Matlab是把一维数组当做n*1的矩阵的,但Numpy里还是有vector和matrix的区别,Theano也是对二者做了区分. 直接把代码贴出来吧,好像也没什么可讲的 = = from scipy.io import loadmat import numpy, cPickle data_dict=loadmat(r'E:\dataset\CIFAR10\CIFAR10_small.mat') #need an r!

  • python读取mat文件中的struct问题

    目录 python读取mat文件中的struct mat文件结构如下 经过查找资料,总结如下 解决办法 python读取mat文件报错 python读取mat文件中的struct All devils are in the details,做个笔记. mat文件结构如下 ground_truth_data 是1x1的struct(结构体),包含2个字段,一个是list,一个是imgszie.如图1所示 图1 list是一个352x1的cell,点开后如图2,可以看到list中的每一个cell又由

  • python读取mat文件生成h5文件的实现

    目录 读取mat文件生成h5文件 1. Matlab生成 .mat 文件 2. 读取 .mat 文件 读取mat文件 基于h5py库 两种数据结构 读取代码 读取mat文件生成h5文件 1. Matlab生成 .mat 文件 p = rand(1,10); q = ones(10); save('pqfile.mat','p','q') 当用python读取 pqfile.mat 这个文件时,可以通过get§, get(q) 分别获得p.q的值. 2. 读取 .mat 文件 import sci

  • Python读取Pickle文件信息并计算与当前时间间隔的方法分析

    本文实例讲述了Python读取Pickle文件信息并计算与当前时间间隔的方法.分享给大家供大家参考,具体如下: python-–读取Pickle文件信息计算出与当前的时间间隔 生成h_dic.pkl文件信息 root@kali:~/python/snmp# cat snmpserver.py #!/usr/bin/python # --*-- coding:utf-8 --*-- import datetime#导入时间戳 import SocketServer import pickle pf

  • Python第三方库h5py_读取mat文件并显示值的方法

    mat数据格式是Matlab默认保存的数据格式.在Python中,我们可以使用h5py库来读取mat文件. >>> import h5py >>> data = h5py.File("**.mat") >>> test = data["digitStruct/name"] #<HDF5 dataset "name": shape (13068, 1), type "|O&quo

  • Python读取mat(matlab数据文件)并实现画图

    目录 Python读取mat(matlab数据文件)并画图 matlab绘图和python绘图 总结 Python读取mat(matlab数据文件)并画图 代码: import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import scipy.io plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False #显示负号 data_snr = scipy.io.loadmat(r'C:\Users\Administrator

  • Python读取ini文件、操作mysql、发送邮件实例

    我是闲的没事干,2014过的太浮夸了,博客也没写几篇,哎~~~ 用这篇来记录即将逝去的2014 python对各种数据库的各种操作满大街都是,不过,我还是喜欢我这种风格的,涉及到其它操作,不过重点还是对数据库的操作.呵~~ Python操作Mysql 首先,我习惯将配置信息写到配置文件,这样修改时可以不用源代码,然后再写通用的函数供调用 新建一个配置文件,就命名为conf.ini,可以写各种配置信息,不过都指明节点(文件格式要求还是较严格的): 复制代码 代码如下: [app_info] DAT

随机推荐