解决python调用matlab时的一些常见问题

为什么要用python调用matlab?

我自己的有些数据结构涉及到hash查找,在python中key是tuple形式,在matlab中支持hash查找的数据结构只有containers.Map(),并不能支持cell作为key。

尝试过把向量转为string,但是num2str和str2mat的效率不高,containers.Map()的查找耗时也非常的长,所以只好作罢。

后来发现可以用python通过matlab的API直接调用matlab的函数参与运算,朋友的经验说矩阵运算都交给matlab来计算就很快了。

但是摸索过程中发现一些问题,在网络上基本找不到,自己全靠摸索发现解决方式,写在这里,如果能给大家带来帮助,那就很好了。

配置python以调用matlab的API

python环境

这里以py2.7和Spyder的anaconda为例。

通过mlab库

这个包直接搜索到官网上下载即可。也可以尝试pip,我已经忘了当时怎么装上的了。

装好之后,使用示例如下:

from mlab.releases import latest_release as matlab
import os
path = os.getcwd()
mat.path(mat.path(),path) # 添加当前脚本所在路径到matlab的环境中
......

所有的matlab(包括自定义函数)的可以通过matlab.xxxx()的方式调用。

mlab包的优点

matlab中的所有变量都是矩阵形式的,到python中会自动转为numpy的array形式,非常方便。

mlab包的缺点

这是最大的BUG!那就是自定义函数在通过mlab在python中调用之后,就好像编译只读了一样,此后对.m文件的任何修改都不起作用,不管是重新启动python的kernel、重新启动spyder、重新import mlab、删除.m文件重建同名函数.m文件,都行不通。删除了.m文件,python报错,除非重新命名一个新函数后调用,那么这个新函数同样面临无法修改的问题。

除非重启电脑。

因此我选择了另一个方式,也是matlab官网介绍的方式。

通过matlab.engine

matlab官网的链接:MATLAB API for Python

安装过程:

1、在matlab安装路径中,找到”R2016b\extern\engines\python”,每个人安装路径不一样,找到末尾一致路径即可

2、这里注意区分,通过anaconda prompt打开其命令行,依次执行:d: –>cd D:\Program Files\MATLAB\R2016b\extern\engines\python,即切换路径到matlab的python的setup.py下

3、官方还给出了较全的安装方案,跟着做就好:在非默认位置安装用于 Python 的 MATLAB 引擎 API

4、安装完成后,python中就可测试以下内容了:

#coding=utf-8
import matlab.engine
from numpy import *
if __name__ == '__main__':
 eng = matlab.engine.start_matlab()
 A = matlab.double([[1,2],[5,6]])
 print(type(A),A.size,A)
 print(eng.eig(A))
 eng.quit()
 pass

matlab.engine包的优点

这是matlab官方介绍的方法,不会出现mlab的那种问题,可以边写程序边调试没问题了。

matlab.engine包的缺点

使用的变量中有许多的matlab类,其中一些在spyder的Variable explorer中无法显示,必须人为打印。

另外就是必须注意python变量类型和matlab变量类型的对应关系,matlab给出了一张表:Pass Data to MATLAB from Python。

我习惯上会把变量以list的方式 [1,2,3] 传入到matlab的函数中,这样matlab里面实际认为是cell,调试中遇到了很多次,实际上如果只传数值到函数中,需要在python中将变量设置为 matlab.double([1,2,3]) 传入才正常。

实用建议

matlab.double类型的变量,可以通过numpy.asarray方式转为array类型的变量,方便在python中处理。

matlab中的函数返回到python中的值默认为1个,需要在函数中增加一个参数nargout=n,如果n与返回的个数不一致,python会报错。

总结

官方介绍的matlab.engine更好用。

matlab负责处理矩阵计算,python用以解决hash查找的数据结构。

目前还在开发初期阶段,并不知道数据在python和matlab之间的通信效率高不高。

第一次写总结,主要是为了给自己总结用,避免以后发生同样的错误。考虑到网络上相关问题的中文介绍非常少,能找到的都是抄过来抄过去的基础配置问题,我这里分享出来,以期能够帮助到其他朋友。

补充:python调用matlab问题解决小建议

软件及python位数要一致

cmd进行build和install时需要管理员权限运行

多个版本的情况下,需要使用python、python2、python3进行python2 setpy.py build这样

函数的参数一般需要matlab.double转换或者参数赋值时直接改为double型

import matlab.engine
eng = matlab.engine.start_matlab()

需要保证你的函数或脚本就在当前的工作路径下,也就是说要把m文件放到python程序中去

matlab.double([44100])
matlab.double([[1.0,1.4142135623730951,1.7320508075688772,2.0,2.23606797749979]])
signal = eng.hanshu(matlab.double([44100]), matlab.double([3000]), matlab.double([5]))

默认情况下,API认为接收函数返回结果的参数有1个。

这会导致没有返回值的函数在被调用时报错:“Too many output arguments”或是多个返回值的情况下只返回并得到第一个返回值

我们可以人为指定输出参数为0个来避免这样的错误。

eng.hanshu(canshu, nargout=2)

以上为个人经验,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持我们。如有错误或未考虑完全的地方,望不吝赐教。

(0)

相关推荐

  • 在python中计算ssim的方法(与Matlab结果一致)

    如下代码可以计算输入的两张图像的结构相似度(SSIM),结果与matlab计算结果一致 // An highlighted block import cv2 import numpy as np def ssim(img1, img2): C1 = (0.01 * 255)**2 C2 = (0.03 * 255)**2 img1 = img1.astype(np.float64) img2 = img2.astype(np.float64) kernel = cv2.getGaussianKe

  • matlab、python中矩阵的互相导入导出方式

    还有一种最流行的h5py.. 过几天更新 ------------在python中导出矩阵至matlab------------ 如果矩阵是mxn维的. 那么可以用 : np.savetxt('dev_ivector.csv', dev_ivector, delimiter = ',') 对应matlab读取为: dev_ivec = csvread('dev_ivector.csv') ###csv格式其实就内定了结构体 如果矩阵是(n,)这种格式.['aagj' 'aagy' 'aann'

  • python matlab库简单用法讲解

    大部分的库都是对应不同的接口使用,然而本期给大家带来的库有点与众不同,涉及的方向是图形化的界面,使用上并不困难,但是也存在着需要注意的使用的,比如安装方面,不同于其他的第三方库,安装的方式不一样,且还需要测试安装后的效果,不然很难去掌控它,好了,下面就来详细的介绍. matlab库安装: python setup.py install 验证安装成功: matlabengineforpython R2017a 语法: matlab.plot([],'') 使用代码: import matlab.e

  • 基于python实现matlab filter函数过程详解

    matlab中的filter函数: y = filter(b,a,x) python实现matlab中的filter函数 def filter_matlab(b,a,x): y = [] y.append(b[0] * x[0]) for i in range(1,len(x)): y.append(0) for j in range(len(b)): if i >= j : y[i] = y[i] + b[j] * x[i - j ] j += 1 for l in range(len(b)-

  • windows下python 3.9 Numpy scipy和matlabplot的安装教程详解

    学习python过程中想使用python的matlabplot绘图功能,遇到了一大批问题,然后一路过关斩将,最终安装成功,实为不易,发帖留念. 1 首先打开cmd win+r 2 pip安装 pip3 install --user numpy scipy matplotlib –user 选项可以设置只安装在当前的用户下,而不是写入到系统目录.默认情况使用国外线路,国外太慢,我们使用清华的镜像就可以: pip3 install numpy scipy matplotlib -i https://

  • 如何用Matlab和Python读取Netcdf文件

    NetCDF(网络通用数据格式)文件后缀为.nc,文件中的数据结构包含维(dimensions).变量(variables)和属性(attributes)三种描述类型,每种类型都会被分配一个名字和一个ID. 从数学上来说,netcdf存储的数据就是一个多自变量的单值函数.用公式来说就是f(x,y,z,...)=value,函数的自变量x,y,z等在netcdf中叫做维(dimension)或坐标轴(axis),函数值value在netcdf中叫做变量(Variables).而自变量和函数值在物理

  • Python使用Matlab命令过程解析

    为了在python中使用matlab命令,也就是import numpy as np 和 import matplotlib.pyplot as plt这两个命令能运行,需要在cmd命令窗口输入 pip install matplotlib,要不然出现 import numpy as np ModuleNotFoundError: No module named 'numpy'的错误. 为达到这一步需要升级pip,这时需在cmd命令窗口输入python -m pip install --upgr

  • 解决python调用matlab时的一些常见问题

    为什么要用python调用matlab? 我自己的有些数据结构涉及到hash查找,在python中key是tuple形式,在matlab中支持hash查找的数据结构只有containers.Map(),并不能支持cell作为key. 尝试过把向量转为string,但是num2str和str2mat的效率不高,containers.Map()的查找耗时也非常的长,所以只好作罢. 后来发现可以用python通过matlab的API直接调用matlab的函数参与运算,朋友的经验说矩阵运算都交给matl

  • 完美解决Python matplotlib绘图时汉字显示不正常的问题

    Matplotlib是一个很好的作图软件,但是python下默认不支持中文,所以需要做一些修改,方法如下: 1.在python安装目录的Lib目录下创建ch.py文件. 文件中代码为: 保存,以后通过以下代码调用: #-*-coding:utf-8-*- #文件名: ch.py def set_ch(): from pylab import mpl mpl.rcParams['font.sans-serif'] = ['FangSong'] # 指定默认字体 mpl.rcParams['axes

  • 解决Python 遍历字典时删除元素报异常的问题

    错误的代码① d = {'a':1, 'b':0, 'c':1, 'd':0} for key, val in d.items(): del(d[k]) 错误的代码② -- 对于Python3 d = {'a':1, 'b':0, 'c':1, 'd':0} for key, val in d.keys(): del(d[k]) 正确的代码 d = {'a':1, 'b':0, 'c':1, 'd':0} keys = list(d.keys()) for key, val in keys: d

  • Android 中解决Viewpage调用notifyDataSetChanged()时界面无刷新的问题

    Android 中解决Viewpage调用notifyDataSetChanged()时界面无刷新的问题 问题描述 相信很多做过Viewpager的人肯定遇到过这个问题,这个是bug还是Android就是如此设计的,我们不做讨论.总之,它确实影响我们功能的实现了. 可能不少同学选择为Viewpager重新设置一遍适配器adapter,达到刷新的目的.但是这种方法在大多数情况下,是有问题的. 解决办法 以我们可以尝试着修改适配器的写法,覆盖getItemPosition()方法,当调用notify

  • 解决python 读取excel时 日期变成数字并加.0的问题

    excel 文件内容如下: 读取excel内容: import xlrd from datetime import datetime from xlrd import xldate_as_datetime, xldate_as_tuple filename = r'C:\Users\Administrator\Desktop\niceloo\10月\流水.xlsx' rbook = xlrd.open_workbook(filename) table = rbook.sheets()[0] ro

  • 解决python中画图时x,y轴名称出现中文乱码的问题

    如下所示: #-*- coding:utf-8 -*- import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from matplotlib.font_manager import FontProperties #k与客户端处理时间的值之间的关系 x=range(2,51,2) y1=[5.393128497232703, 9.57638681757734, 13.828038570286598, 17.88060602988053, 22.943

  • 解决python测试opencv时imread导致的错误问题

    如下所示: import cv2 import numpy as np img = cv2.imread("1.jpg")//图片和代码在同个目录,改为相对路径,解决由imread引起的打不开图片或找不到图片的路径问题 cv2.imshow("1",img) cv2.waitKey(10000) D:\>my.py OpenCV Error: Assertion failed (size.width>0 && size.height>

  • python调用matlab的m自定义函数方法

    项目信号处理和提取部分用到了matlab,需要应用到工程中方便研究.用具有万能粘合剂之称的"Python".具体方法如下: 1.python中安装mlab 下载https://pypi.python.org/pypi/mlab 安装命令:python setup.py install Mlab is a high-level python to Matlab bridge that lets Matlab look like a normal python library. 2 .测试

  • 解决Pycharm调用Turtle时 窗口一闪而过的问题

    如下所示: #彩色螺旋线 import turtle turtle.pensize(2) turtle.bgcolor("black") colors = ["red","yellow","purple","blue"] turtle.tracer(False) for x in range(400): turtle.forward(2*x) turtle.color(colors[x % 4]) turt

  • 解决python使用list()时总是报错的问题

    如下所示: Traceback (most recent call last): File "<stdin>", line 1, in <module> TypeError: 'list' object is not callable 刚开始学习python的时候,可能会由于命名的不注意,导致也方法一直用不了,原因是在声明变量对的时候和python内置方法冲突了,导致方法被重新定义了,这样一来,方法自然也就不存在了 解决办法: 先复制个其他的list c = l

随机推荐