R语言绘图技巧导出高清图方法

目录 更新前原文 作图方法: Step1. 绘图数据的准备 Step2. 绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的安装.调用 Step4.绘图数据格式调整 Step5.绘图 填充透明度调整方法如下: 1.取消编组 2.选中线条,对象—实时上色—建立 3.选中线条,对象—拓展 4.更改填充颜色,输入相应颜色RGB数值 5.删掉图形白色背景 6.外观—填色—不透明度—调整数值 对于导出带有透明度的高清图,小仙又发现了更懒的办法,特来更新 再Rstudio里调整好透明度之后,直接导出pdf

最近小仙同学在好几篇文献里看到了这种小提琴图,暂时就肤浅地认为这是作者为了更好地比较对照组与实验组的差别,所以将同一个基因的小提琴图各画了一半,放在一起.为了跟上可视化的潮流,小仙也来尝试画一下这个没查到正经名字的图. Step1. 绘图数据的准备 首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,建议大家在excel中保存成csv格式.作图数据格式如下: Step2. 绘图数据的读取 data<-read.csv("your file path", header = T) #

目录 Step 1. 绘图数据的准备 Step2. 绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的调用 Step4. 饼图百分比标签准备 Step5.绘图 今天要给大家介绍的Pie chart(饼图),本来是不打算写这个的,因为用Excel画饼图实在是太方便了.本着能少动一下是一下的懒人原则,是不打算用R画的,再说,本小仙不是掌握了R作图大器ggplot2么,实在需要用的时候我就一句ggplot()+geom_pie()不就搞定了. 结果后来用Excel画饼图调整颜色.大小的时候着实有些崩

目录 第一种实现方法:用aggregate计算数据 第二种实现方法:用dplyr包计算数据 笔者近期画了一张带error bar的分组条形图,将相关的代码分享一下. 感谢网友青山屋主的建议,提示笔者要严谨区分技术重复和生物学重复,所以笔者对文章做修改后重发.如果各位有任何建议,欢迎指正. 本文旨在给出一种利用R对生物学重复数据画带error bar的分组条形图的方法. 所用数据是模拟生成的:分成三个组,每个组进行了若干次生物学重复:测量的是3种基因的表达量.数据的部分内容如下: ## gene1

上一次小仙同学分享了 facet violin plot的画法,最后还卖了个关子,给大家留了个悬念.科研文章的插图通常要求比较高,不仅要精准地展示出数据,选对图表类型,还需要简洁优美(?翻译成人话就是,同样的数据能不能多“卖”几分,就看图够不够高大上啦).小仙同学在画图的时候遇到的一个问题就是,RStudio直接导出的图,怎么这么不清晰?为什么教程里别人的图都那么清晰呢?这时候可能就有同学就会说,这还不简单,直接导出矢量图不就可以了吗? 我们来看下,RStudio可以导出的图片格式有这么几种,小

目录 Step 1. 绘图数据的准备 Step2. 绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的调用 Step4. 饼图百分比标签准备 Step5.绘图 今天要给大家介绍的Pie chart(饼图),本来是不打算写这个的,因为用Excel画饼图实在是太方便了.本着能少动一下是一下的懒人原则,是不打算用R画的,再说,本小仙不是掌握了R作图大器ggplot2么,实在需要用的时候我就一句ggplot()+geom_pie()不就搞定了. 结果后来用Excel画饼图调整颜色.大小的时候着实有些崩

上次分享了小提琴曲线(violin plot)的作图方法,今天小仙同学给大家介绍一下如何用R画出漂亮的密度图(density plot). Step1. 绘图数据的准备 首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,把excel保存成csv格式. 数据的格式如下图:一列表示一种变量,第一行是列名 Step2. 绘图数据的读取 data<-read.csv("your file path", header = T) #注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没

目录 Step1. 绘图数据的准备 Step2. 绘图数据的读取 Step3. 绘图所需package的安装.调用 Step4. 绘图 调整透明度 更改顺序 更改线条形状 今天给大家介绍一下Ridgeline plot(山脊图)的画法. 作图数据如下: Step1. 绘图数据的准备 首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,建议大家在excel中保存成csv格式. Step2. 绘图数据的读取 data<-read.csv("your file path", heade

不同系统的字体库目录: Linux 一般在 /usr/share/fonts 下,我们可以使用 fc-list 命令查看: # fc-list /usr/share/fonts/truetype/dejavu/DejaVuSerif-Bold.ttf: DejaVu Serif:style=Bold /usr/share/fonts/truetype/dejavu/DejaVuSansMono.ttf: DejaVu Sans Mono:style=Book /usr/share/fonts/t

在R语言中,par 函数可以设置图形边距,其中oma 参数设置outer margin, mar 参数设置margin, 这些边距有什么不同呢,通过box函数可以直观的看到 box 默认在当前图形绘制边框,第一个参数which = "plot", 所以在当前图形上绘制边框 which 的值除了plot 之外,还可以选择 figure, inner, outer 接下来分别用不同的值测试一下,为了区分,为不同的边框设置不同的颜色和类型,代码如下: attach(mtcars) plot(

目录 希腊字母 上下标 paste 一个复杂的例子 进阶 数学公式 通常在我们写论文时,所需要的统计图是非常严谨的,里面的希腊字符与上下脚标都必须要严格书写.因此在使用R绘图时,如何在我们目标图中使用希腊字符.上标.下标及一些数学公式呢?在本博客中我们会进行详细的说明. 后面我们都将以一个最简单的绘图为例,只是将其标题进行修改. 希腊字母 使用希腊字符.上标.下标及数学公式,都需要利用一个函数:expression(),具体使用方式如下: plot(cars) title(main = expr

目录 Step1.绘图数据的准备 Step2.绘图数据的读取 Step3.绘图所需package的安装.调用 Step4.绘图 Step5.美化 又是一个好久不见,朋友们你们最近还好吗!最近小仙同学刚经历了人生中的一个重要的里程碑——延毕.在预料之中.又如期而至的两个字,小仙心里也是很复杂,可终究跟“毕业”二字沾了边,就当它是好事啦! 今天要给大家介绍的是气泡矩阵图,要模仿的图形如下.小仙同学一直有一个困惑:什么样的数据应该画什么类型的图,才能精确地展示数据表达出自己的意思?对于气泡矩阵图,小仙

目录 导读 一.模拟输入 二.venn基础图 三.个性化参数调整 四.保存 导读 使用VennDiagram函数包中的venn.diagram函数绘制三数据集venn图. 安装依赖包: # venn图 install.packages("VennDiagram") library(VennDiagram) 一.模拟输入 产生3个含200字符串的数据集 set1 <- paste(rep("word_" , 200) , sample(c(1:1000) , 2