linux命令行下使用R语言绘图实例讲解

使用系统：centos 6.4 64bit

在R语言中可以使用png()等函数生成图片，例如： png("aa.png")可以生成图片。

但是如果你是通过shell远程连接到系统上，可能会碰到如下错误：

> png("aa.png")

错误于.External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width,  : 

  无法打开PNG设备

此外: 警告信息：

In png("aa.png") : 无法打开链结到X11显示''

分析：

打开R控制台，输入capabilities()，可以看到：

> capabilities()
  jpeg   png   tiff  tcltk   X11   aqua http/ftp sockets
  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE   TRUE   TRUE
 libxml   fifo  cledit  iconv   NLS profmem  cairo
  TRUE   TRUE   TRUE   TRUE   TRUE  FALSE  FALSE

可以看到png为false，因为生成图片需要X11，但是shell是没有X11的。

怎么解决：

1.在X11模式下执行R语言命令，也就是在linux的桌面。如果你只是在桌面上画画图，那选择这个方式就可以了。

2.不使用X11生成,使用 图形渲染库Cairo。比如我，需要用脚本，根据实时数据生成统计图，那么用这个方式就很方便。

安装：

启动R控制台

安装

install.packages("Cairo")

会让你选择安装镜像

--- 在此連線階段时请选用CRAN的鏡子 ---
CRAN mirror 

 1: 0-Cloud            2: Argentina (La Plata)
 3: Argentina (Mendoza)      4: Australia (Canberra)
 5: Australia (Melbourne)     6: Austria
 7: Belgium            8: Brazil (BA)
 9: Brazil (PR)         10: Brazil (RJ)
11: Brazil (SP 1)        12: Brazil (SP 2)
13: Canada (BC)         14: Canada (NS)
15: Canada (ON)         16: Canada (QC 1)
17: Canada (QC 2)        18: Chile
19: China (Beijing 1)      20: China (Beijing 2)
选一个北京的好了：20

安装出错

configure: error: Cannot find cairo.h! Please install cairo (http://www.cairographics.org/) and/or set CAIRO_CFLAGS/LIBS correspondingly.

所以我们需要先在系统中安装cairo库

yum -y install cairo* libxt*
安装完成之后，重新执行：install.packages("Cairo")
installing to /usr/local/lib64/R/library/Cairo/libs
** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (Cairo)

下载的程序包在
‘/tmp/RtmpNlGyf3/downloaded_packages'里
更新'.Library'里的HTML程序包列表
Making 'packages.html' ... 做完了。

安装成功。

加载Cairo后，查看支持：

> library(Cairo)
> Cairo.capabilities()
  png  jpeg  tiff  pdf  svg   ps  x11  win raster
 TRUE FALSE FALSE  TRUE  TRUE  TRUE  TRUE FALSE  TRUE
说明已经支持用cairo生成图片了。
例如可以使用如下命令生成PNG：
CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

附上一个测试小程序，主要为了说明用法：

#vim test.r
library(Cairo)

CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

plot(5,4)

保存后执行：

[root@localhost ~]# Rscript test.r 

R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"
Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
> library(Cairo)
> CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)
> plot(5,4)
>

在当前目录下可以看到生成了图片

[root@localhost ~]# ll
总用量 84
-rw-r--r--. 1 root root 6832 5月 13 10:33 out.png
-rw-r--r--. 1 root root  71 5月 13 10:32 test.r

到此这篇关于linux命令行下使用R语言绘图实例讲解的文章就介绍到这了,更多相关linux命令行下使用R语言绘图内容请搜索我们以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持我们！

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