linux命令行下使用R语言绘图实例讲解

使用系统：centos 6.4 64bit

在R语言中可以使用png()等函数生成图片，例如： png("aa.png")可以生成图片。

但是如果你是通过shell远程连接到系统上，可能会碰到如下错误：

> png("aa.png")

错误于.External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width,  : 

  无法打开PNG设备

此外: 警告信息：

In png("aa.png") : 无法打开链结到X11显示''

分析：

打开R控制台，输入capabilities()，可以看到：

> capabilities()
  jpeg   png   tiff  tcltk   X11   aqua http/ftp sockets
  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE   TRUE   TRUE
 libxml   fifo  cledit  iconv   NLS profmem  cairo
  TRUE   TRUE   TRUE   TRUE   TRUE  FALSE  FALSE

可以看到png为false，因为生成图片需要X11，但是shell是没有X11的。

怎么解决：

1.在X11模式下执行R语言命令，也就是在linux的桌面。如果你只是在桌面上画画图，那选择这个方式就可以了。

2.不使用X11生成,使用 图形渲染库Cairo。比如我，需要用脚本，根据实时数据生成统计图，那么用这个方式就很方便。

安装：

启动R控制台

安装

install.packages("Cairo")

会让你选择安装镜像

--- 在此連線階段时请选用CRAN的鏡子 ---
CRAN mirror 

 1: 0-Cloud            2: Argentina (La Plata)
 3: Argentina (Mendoza)      4: Australia (Canberra)
 5: Australia (Melbourne)     6: Austria
 7: Belgium            8: Brazil (BA)
 9: Brazil (PR)         10: Brazil (RJ)
11: Brazil (SP 1)        12: Brazil (SP 2)
13: Canada (BC)         14: Canada (NS)
15: Canada (ON)         16: Canada (QC 1)
17: Canada (QC 2)        18: Chile
19: China (Beijing 1)      20: China (Beijing 2)
选一个北京的好了：20

安装出错

configure: error: Cannot find cairo.h! Please install cairo (http://www.cairographics.org/) and/or set CAIRO_CFLAGS/LIBS correspondingly.

所以我们需要先在系统中安装cairo库

yum -y install cairo* libxt*
安装完成之后，重新执行：install.packages("Cairo")
installing to /usr/local/lib64/R/library/Cairo/libs
** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (Cairo)

下载的程序包在
‘/tmp/RtmpNlGyf3/downloaded_packages'里
更新'.Library'里的HTML程序包列表
Making 'packages.html' ... 做完了。

安装成功。

加载Cairo后，查看支持：

> library(Cairo)
> Cairo.capabilities()
  png  jpeg  tiff  pdf  svg   ps  x11  win raster
 TRUE FALSE FALSE  TRUE  TRUE  TRUE  TRUE FALSE  TRUE
说明已经支持用cairo生成图片了。
例如可以使用如下命令生成PNG：
CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

附上一个测试小程序，主要为了说明用法：

#vim test.r
library(Cairo)

CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

plot(5,4)

保存后执行：

[root@localhost ~]# Rscript test.r 

R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"
Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
> library(Cairo)
> CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)
> plot(5,4)
>

在当前目录下可以看到生成了图片

[root@localhost ~]# ll
总用量 84
-rw-r--r--. 1 root root 6832 5月 13 10:33 out.png
-rw-r--r--. 1 root root  71 5月 13 10:32 test.r

到此这篇关于linux命令行下使用R语言绘图实例讲解的文章就介绍到这了,更多相关linux命令行下使用R语言绘图内容请搜索我们以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持我们！

赞 (0)

相关推荐

  • R语言写2048游戏实例讲解

    R语言写2048游戏实例讲解

    2048 是一款益智游戏,只需要用方向键让两两相同的数字碰撞就会诞生一个翻倍的数字,初始数字由 2 或者 4 构成,直到游戏界面全部被填满,游戏结束. 编程时并未查看原作者代码,不喜勿喷. 程序结构如下: R语言代码: #!/usr/bin/Rscript #画背景 draw_bg <- function(){ plot(0,0,xlim=c(0,0.8),ylim=c(0,0.8),type='n',xaxs="i", yaxs="i") for (i in

  • R语言的xtabs函数实例讲解

    今天在做一个列联表独立性检验的时候,总是无法处理好要求的数据类型,偶然的机会,看到了xtabs()函数,感觉很适合用来做列联表,适合将一列数据转换成列联表. shifou <- c("yes","yes","no","no") xinbie <- c("nan","nv","nan","nv") freq <- c(34,38,2

  • R语言基本语法深入讲解

    基本数据类型 数据类型 向量 vector 矩阵 matrix 数组 array 数据框 data frame 因子 factor 列表 list 向量 单个数值(标量)没有单独的数据类型,它只不过是向量的一种特例 向量的元素必须属于某种模式(mode),可以整型(integer).数值型(numeric).字符型(character).逻辑型(logical).复数型(complex) 循环补齐(recycle):在一定情况下自动延长向量 筛选:提取向量子集 向量化:对向量的每一个元素应用函数

  • R语言绘制空间热力图实例讲解

    R语言绘制空间热力图实例讲解

    先上图 R语言的REmap包拥有非常强大的空间热力图以及空间迁移图功能,里面内置了国内外诸多城市坐标数据,使用起来方便快捷. 开始首先安装相关包 install_packages("devtools") install_packages("REmap") library(devtools) library(REmap) 我们来试试其强大的城市坐标获取功能 city<- c("beijing","上海") get_geo_

  • R语言 用均值替换、回归插补及多重插补进行插补的操作

    R语言 用均值替换、回归插补及多重插补进行插补的操作

    用均值替换.回归插补及多重插补进行插补 # 设置工作空间 # 把"数据及程序"文件夹拷贝到F盘下,再用setwd设置工作空间 setwd("E:\\R_workspace\\R语言数据分析与挖掘实战\\chp4") # 读取销售数据文件,提取标题行 inputfile <- read.csv('./data/catering_sale.csv', header = TRUE) View(inputfile) # 变换变量名 inputfile <- da

  • R语言归一化处理实例讲解

    R语言归一化处理实例讲解

    归一化就是要把你需要处理的数据经过处理后(通过某种算法)限制在你需要的一定范围内.首先归一化是为了后面数据处理的方便,其次是保正程序运行时收敛加快. R语言中的归一化函数:scale 数据归一化包括数据的中心化和数据的标准化. 1. 数据的中心化 所谓数据的中心化是指数据集中的各项数据减去数据集的均值. 例如有数据集1, 2, 3, 6, 3,其均值为3,那么中心化之后的数据集为1-3,2-3,3-3,6-3,3-3,即:-2,-1,0,3,0 2. 数据的标准化 所谓数据的标准化是指中心化之后

  • R语言实现对数据框按某一列分组求组内平均值

    可使用aggregate函数 如: aggregate(.~ID,data=这个数据框名字,mean) 如果是对数据框分组,组内有重复的项,对于重复项保留最后一行数据用: pcm_df$duplicated <- duplicated(paste(pcm_df$OUT_MAT_NO, pcm_df$Posit, sep = "_"), fromLast = TRUE) pcm_df <- subset(pcm_df, !duplicated) pcm_df$duplicat

  • linux命令行下使用R语言绘图实例讲解

    使用系统:centos 6.4 64bit 在R语言中可以使用png()等函数生成图片,例如: png("aa.png")可以生成图片. 但是如果你是通过shell远程连接到系统上,可能会碰到如下错误: > png("aa.png") 错误于.External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width,  :    无法打开PNG设备 此外: 警告信息: In

  • linux命令行下使用curl命令查看自己机器的外网ip

    Linux命令行下如何查看自己机器的外网ip?可以在命令行下使用curl命令实现这个功能,试一下下面的命令吧 复制代码 代码如下: curl ifconfig.me 输入此条命令,就可以获取到本机的外网ip.

  • 关于Linux命令行下的数学运算示例详解

    前言 有几个有趣的命令可以在 Linux 系统下做数学运算: expr . factor . jot 和 bc 命令. 可以在 Linux 命令行下做数学运算吗?当然可以!事实上,有不少命令可以轻松完成这些操作,其中一些甚至让你大吃一惊.让我们来学习这些有用的数学运算命令或命令语法吧. expr 首先,对于在命令行使用命令进行数学运算,可能最容易想到.最常用的命令就是 expr ( 表达式 expression .它可以完成四则运算,也可以用于比较大小.下面是几个例子: 变量递增 $ count

  • Linux命令行下编译Android NDK的示例代码

    这几天琢磨写一个Android的Runtime用来加速HTML5 Canvas,让GameBuilder+CanTK 不但开发速度快,运行速度也能接近原生应用.所以花了点时间研究Android NDK,网上的资料都是讲IDE里的编译方法,这里记录一下命令行下的编译方法,供有需要的朋友参考. 这里以编译hello-gl2为例: 0.安装Android NDK/SDK,设置PATH变量(根据具体情况调整) PATH=$PATH:/work/android/android-sdk-linux/plat

  • Linux 命令行工具解析和格式化输出 JSON的方法

    JSON 是一种轻量级且与语言无关的数据存储格式,易于与大多数编程语言集成,也易于人类理解 -- 当然,如果格式正确的话.JSON 这个词代表 J ava S cript O bject N otation,虽然它以 JavaScript 开头,而且主要用于在服务器和浏览器之间交换数据,但现在正在用于许多领域,包括嵌入式系统.在这里,我们将使用 Linux 上的命令行工具解析并格式化打印 JSON.它对于在 shell 脚本中处理大型 JSON 数据或在 shell 脚本中处理 JSON 数据非

  • 在Linux命令行中使用计算器的5个命令详解

    大家好,我是良许. 在使用 Linux 时,我们有时会需要做一些计算,那么我们就可能需要用到计算器.在 Linux 命令行里,有许多计算器工具,这些命令行计算器可以让我们执行科学计算.财务计算或者一些简单的计算.当然,我们也可以在 Shell 脚本中使用这些命令执行更为复杂的数学运算. 这里我们主要介绍5种命令行计算器: bc calc expr gcalccmd qalc 1. 如何在 Linux 中使用 bc 执行计算 bc 是一种以交互式语句执行的方式支持任意精度的数字的语言,它的语法和

  • R语言绘图如何支持中文

    R语言绘图如何支持中文

    不同系统的字体库目录: Linux 一般在 /usr/share/fonts 下,我们可以使用 fc-list 命令查看: # fc-list /usr/share/fonts/truetype/dejavu/DejaVuSerif-Bold.ttf: DejaVu Serif:style=Bold /usr/share/fonts/truetype/dejavu/DejaVuSansMono.ttf: DejaVu Sans Mono:style=Book /usr/share/fonts/t

  • 在 Linux 命令行中使用 tcpdump 抓包的一些功能

    tcpdump 是一款灵活.功能强大的抓包工具,能有效地帮助排查网络故障问题. 以我作为管理员的经验,在网络连接中经常遇到十分难以排查的故障问题.对于这类情况, tcpdump 便能派上用场. tcpdump 是一个命令行实用工具,允许你抓取和分析经过系统的流量数据包.它通常被用作于网络故障分析工具以及安全工具. tcpdump 是一款强大的工具,支持多种选项和过滤规则,适用场景十分广泛.由于它是命令行工具,因此适用于在远程服务器或者没有图形界面的设备中收集数据包以便于事后分析.它可以在后台启动

  • 通过python连接Linux命令行代码实例

    这篇文章主要介绍了通过python连接Linux命令行代码实例,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友可以参考下 代码如下 #!/usr/bin/python # -*- coding: utf-8 -*- '''https://www.ibm.com/developerworks/cn/linux/l-cn-pexpect2/index.html''' import pexpect import types username = "root&qu

  • mongodb 命令行下及php中insert数据详解

    前面说了到数据库连接操作,请参考:mongodb 添加用户及权限设置详解 对数据库的操作:请参考:mongodb 数据库操作详解--创建,切换,删除 下面说一下,数据库表的插入操作 1,命令行下的insert操作 > use test; #切换到test数据库 switched to db test > document=({"title" : "linux命令", "auther" : "tank" }); #定

随机推荐