基于Matlab实现山脊图的绘制

目录

• 纯色山脊图模板
• 渐变色山脊图模板

写了一个用于绘制山脊图的模板，仅需要往需要填写数据的区域填入数据点击运行即可，以下提供两款模板，第一款为纯色模板而第二款为渐变色模板：

纯色山脊图模板

模板代码：

function ridgeMapTMPL1
% @author: slandarer

% 在这里放入你的数据=======================================================
X1=normrnd(2,2,1,1000);
X2=[normrnd(4,4,1,1000),normrnd(5,2,1,200)];
X3=[normrnd(2.5,2,1,1000),normrnd(6,4,1,200)];
X4=[normrnd(1,1,1,300),normrnd(2,4,1,200)];
X5=[normrnd(4,2,1,300),normrnd(2,4,1,600)];

% 把数据放到元胞数组，要是数据太多可写循环放入
dataCell={X1,X2,X3,X4,X5};    

% 各个数据类的名称，可空着
dataName={'A','B','C','D','E'};

% 各个山脊的颜色，可空着也可只放一个颜色
colorList=[];                  

% 非必要属性
% -------------------------------------------------------------------------
legendOn=false;  % 是否绘制图例 true/false
xTickOn=true;    % 开启X轴

sep=1/6;         % 设置山脊距离，可空着
xLim=[];         % 设置X轴范围距离，可空着
axColor=[];      % 设置背景颜色，可空着
fontName='';     % 设置X，Y轴标签字体，可空着
fontSize=14;     % 设置X，Y轴标签字号，可空着
faceAlpha=1;           % 面透明度
edgeColor=[1,1,1].*.3; % 边缘颜色
% =========================================================================

% 设置颜色
classNum=length(dataCell);
if size(colorList,1)==0
    colorList=repmat([130,170,172]./255,[classNum,1]);
else
    colorList=repmat(colorList,[ceil(classNum/size(colorList,1)),1]);
end

% 设置间隙距离
if isempty(sep)
sep=1/6;
end

hold on
ax=gca;
ax.YGrid='on';
ax.YLim=[0,sep*classNum+sep/2];
ax.YTick=0:sep:sep*(classNum-1);
ax.YColor='none';
ax.LineWidth=1.2;
% ax.YTickLabel=dataName;
if isempty(fontName),fontName='Helvetica';end
if isempty(fontSize),fontSize=14;end
ax.FontName=fontName;
ax.FontSize=fontSize;
if ~xTickOn,ax.XColor='none';end
if ~isempty(xLim),ax.XLim=xLim;end
if ~isempty(axColor),ax.Color=axColor;end
if isempty(dataName)
    for i=1:classNum
        dataName{i}=num2str(i);
    end
end

% 绘制山脊
for i=1:classNum
    tX=dataCell{i};tX=tX(:);
    [F,Xi]=ksdensity(tX);
    patchCell(i)=fill([Xi(1),Xi,Xi(end)],[0,F,0]+(sep).*(classNum-i).*ones(1,length(F)+2),...
        colorList(i,:),'EdgeColor','none','FaceAlpha',faceAlpha);
    plot([Xi(1),Xi,Xi(end)],[0,F,0]+(sep).*(classNum-i).*ones(1,length(F)+2),...
        'Color',edgeColor,'LineWidth',1.2)
end

% 绘制图例
if legendOn
legend(patchCell,dataName)
end

% 绘制字符
ax.UserData.classNum=classNum;
ax.UserData.sep=sep;
for k=1:classNum
    ax.UserData.(['t',num2str(k)])=text(ax.XLim(1),(sep).*(classNum-k),[dataName{k},' '],...
        'FontSize',fontSize,'FontName',fontName,'HorizontalAlignment','right','VerticalAlignment','bottom');
end
    function reTXT(~,~)
        for kk=1:ax.UserData.classNum
            ax.UserData.(['t',num2str(kk)]).Position=...
                [ax.XLim(1),(ax.UserData.sep).*(ax.UserData.classNum-kk),0];
        end
    end

set(ax.Parent,'WindowButtonMotionFcn',@reTXT);
% 额外的属性设置===========================================================
% ax.(...)=...

% =========================================================================
end

绘制效果：

更该部分配置后的绘制效果：

将每个山脊赋予不同颜色，删除X轴并添加图例

% 在这里放入你的数据=======================================================
X1=normrnd(2,2,1,1000);
X2=[normrnd(4,4,1,1000),normrnd(5,2,1,200)];
X3=[normrnd(2.5,2,1,1000),normrnd(6,4,1,200)];
X4=[normrnd(1,1,1,300),normrnd(2,4,1,200)];
X5=[normrnd(4,2,1,300),normrnd(2,4,1,600)];

% 把数据放到元胞数组，要是数据太多可写循环放入
dataCell={X1,X2,X3,X4,X5};    

% 各个数据类的名称，可空着
dataName={'A','B','C','D','E'};

% 各个山脊的颜色，可空着也可只放一个颜色
colorList=[0.98,0.70,0.95
0.69,0.81,1.00
0.50,0.88,0.89
0.50,0.87,0.61
0.86,0.82,0.50];                  

% 非必要属性
% -------------------------------------------------------------------------
legendOn=true;  % 是否绘制图例 true/false
xTickOn=false;   % 开启X轴

sep=1/6;         % 设置山脊距离，可空着
xLim=[];         % 设置X轴范围距离，可空着
axColor=[];      % 设置背景颜色，可空着
fontName=[];     % 设置X，Y轴标签字体，可空着
fontSize=14;     % 设置X，Y轴标签字号，可空着
faceAlpha=1;           % 面透明度
edgeColor=[1,1,1].*.3; % 边缘颜色
% ===============================================================

渐变色山脊图模板

模板代码：

function ridgeMapTMPL2
% @author: slandarer

% 在这里放入你的数据=======================================================
X1=normrnd(2,2,1,1000);
X2=[normrnd(4,4,1,1000),normrnd(5,2,1,200)];
X3=[normrnd(2.5,2,1,1000),normrnd(6,4,1,200)];
X4=[normrnd(1,1,1,300),normrnd(2,4,1,200)];
X5=[normrnd(4,2,1,300),normrnd(2,4,1,600)];

% 把数据放到元胞数组，要是数据太多可写循环放入
dataCell={X1,X2,X3,X4,X5};    

% 各个数据类的名称，可空着
dataName={'A','B','C','D','E'};

% 山脊的渐变颜色，可空着也放数组也可放颜色名称
cmap=[];
% cmap=PYCM().plasma();
% cmap='colorcube'

% 非必要属性
% -------------------------------------------------------------------------
xTickOn=true;    % 开启X轴

sep=1/6;         % 设置山脊距离，可空着
xLim=[];         % 设置X轴范围距离，可空着
fontName='';     % 设置X，Y轴标签字体，可空着
fontSize=14;     % 设置X，Y轴标签字号，可空着
% =========================================================================

classNum=length(dataCell);

% 设置间隙距离
if isempty(sep)
sep=1/6;
end

hold on
ax=gca;
ax.YGrid='on';
ax.YLim=[0,sep*classNum+sep/2];
ax.YTick=0:sep:sep*(classNum-1);
ax.YColor='none';
ax.LineWidth=1.2;
% ax.YTickLabel=dataName;
if isempty(fontName),fontName='Helvetica';end
if isempty(fontSize),fontSize=14;end

ax.FontName=fontName;
ax.FontSize=fontSize;
if ~xTickOn,ax.XColor='none';end
if ~isempty(xLim),ax.XLim=xLim;end
if isempty(dataName)
    for i=1:classNum
        dataName{i}=num2str(i);
    end
end

% 绘制山脊
for i=1:classNum
    tX=dataCell{i};tX=tX(:);
    [F,Xi]=ksdensity(tX);
    patchCell(i)=patch([Xi(1),Xi,Xi(end)],[0,F,0]+(sep).*(classNum-i).*ones(1,length(F)+2),...
        [Xi(1),Xi,Xi(end)],'FaceColor','interp','EdgeColor','none');
    plot([Xi(1),Xi,Xi(end)],[0,F,0]+(sep).*(classNum-i).*ones(1,length(F)+2),...
        'Color',[.3,.3,.3],'LineWidth',1.2)
end
if isempty(cmap)
colormap()
else
colormap(cmap)
end

% 绘制字符
ax.UserData.classNum=classNum;
ax.UserData.sep=sep;
for k=1:classNum
    ax.UserData.(['t',num2str(k)])=text(ax.XLim(1),(sep).*(classNum-k),[dataName{k},' '],...
        'FontSize',fontSize,'FontName',fontName,'HorizontalAlignment','right','VerticalAlignment','bottom');
end
    function reTXT(~,~)
        for kk=1:ax.UserData.classNum
            ax.UserData.(['t',num2str(kk)]).Position=...
                [ax.XLim(1),(ax.UserData.sep).*(ax.UserData.classNum-kk),0];
        end
    end

set(ax.Parent,'WindowButtonMotionFcn',@reTXT);
% 额外的属性设置===========================================================
% ax.(...)=...

% =========================================================================
end

绘制效果：

使用MATLAB自带颜色：

例：将cmap=[]改为：

cmap='summer'

cmap='colorcube'

使用PYCM函数：

例：将cmap=[]改为：

cmap=PYCM().plasma()

到此这篇关于基于Matlab实现山脊图的绘制的文章就介绍到这了,更多相关Matlab山脊图内容请搜索我们以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持我们！