matplotlib一维散点分布图的实现
目录
- 引言
- 方法
- 测试结果
- 参考
引言
本次的目标是绘制数据的一维散点分布图,应用场景是数据一维标签的聚类可视化,假定我们拥有原始的带标签数据 ( X , y ) (X,y) (X,y)其中 X X X为样本特征矩阵, y y y为对应样本的标签(连续值),通过聚类算法得到了 X X X的伪分类标签 y ^ , y ^ ∈ ( 1 , 2 , . . . , N ) \hat{y}, \hat{y}\in(1,2,...,N) y^,y^∈(1,2,...,N),想要绘制出相同类别样本在标签值是否同样是集中的。
值得注意的是,由于我们可能获得多类样本,因此仅仅使用一张图来进行绘制可能会使得不同类别样本的marker在图上相互重叠,因此需要为每一类样本单独绘制一维散点分布图,并在同一张画布上显示。
方法
为了显示一维的单张散点分布图,我们需要对matplotlib默认的二维画布进行调整,将其余三条轴线都设置为不可见,只保留底部的轴线,进一步的,要把纵轴label的位置向图左端移动(否则在横轴包括负半轴时,label会出现在图中央),实例代码如下:
axs.spines['top'].set_visible(False) axs.spines['right'].set_visible(False) axs.spines['left'].set_visible(False) axs.yaxis.set_ticks_position('left') axs.set_xlim((-0.05,1.05)) axs.set_ylim((0,1)) axs.set_yticks([0],labels=['score'])
对于多张一维散点图的绘制,只需要利用subplot函数,对子图重复进行上述操作即可。整体代码如下:
def score_distr(group,x_lim=(-0.1,1.1),y_lim=(-0.1,1.1)): ''' 可视化N个类别中每个样本的y分布 :param group: List[np.ndarray], N类样本标签y组成的数组 :param x_lim: 横坐标区间 :param y_lim: 纵坐标区间 :return: ''' group_num=len(group) color_map=["violet","tomato","cyan","salmon","limegreen"] fig,axs=plt.subplots(group_num,1) dem_labels=[] for i in range(group_num): axs[i].scatter(group[i],[0.05]*group[i].shape[0],label="class_"+str(i),c=color_map[i]) # axs[i].xlim(x_lim) dem_labels.append("class_"+str(i)) axs[i].spines['top'].set_visible(False) axs[i].spines['right'].set_visible(False) axs[i].spines['left'].set_visible(False) axs[i].yaxis.set_ticks_position('left') axs[i].set_xlim(x_lim) axs[i].set_ylim(y_lim) axs[i].set_yticks([0],labels=['score']) fig.legend(dem_labels,loc=(0.45,0.85))
测试结果
给出示例代码及对应结果如下:
test=[] for i in range(3): test.append(np.random.rand(15)) score_distr(test,x_lim=(-1.05,1.05))
结果:
参考
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